「幻想少女大戦」では総勢70名以上のキャラクターを操作することができます。その一部をご紹介します。
博麗神社の巫女さん。 持ち前の才能を活かして「かわして当てる」ことのできるオールラウンダー。 どんなシーンでも活躍できる。
普通の魔法使い。 光や星などの、派手で力任せな魔法を得意とする。 燃費の悪さが玉にキズ。
人里で寺子屋を開く、半人半獣の先生。 固い信念と防御力で仲間を守る。 お仕置きで繰り出すという「頭突き」はすさまじい威力。
妖怪の山から人里に下りてきた河童のエンジニア。 離れた仲間にアイテムを渡す等、様々な発明品で仲間を強力にサポートする。 人間に対しては友好的だが人見知りする。
冥界の白玉楼に住む半分人間、半分幽霊の庭師であり剣士。 「楼観剣」と「白楼剣」の二振りを用いた近接戦闘を得意とする。 真面目な性格だが、やや天然な所がありからかわれやすい。
魔法の森に住む人形師であり元人間の魔法使い。 非常に手先が器用で、大量の人形を同時に使役して戦う。 親切で常識があるが魔理沙とは犬猿の仲で、意外と好戦的な所も。
霧の湖に住む、妖怪に匹敵する力を持つ氷の妖精。 子供っぽい性格で頭は良くないが、友情には熱いところも見せる。 一年中体から冷気を出しているので、周辺は寒い。
「紅魔館」の主に仕える人間のメイド長。 凄まじいまでのナイフ捌きに加え、時間を操るという恐るべき力を持つ。 他者に対しては距離がある様だが……?
幻想郷の外からやってきたという「もう一人の巫女」。 神の力を借り、信仰を高める程に強力な奇跡を起こす事ができる。 責任感が強く、博麗神社の競合相手として霊夢一行に宣戦布告する。